Реагенты для секвенирования по Сэнгеру

Химический состав набора идеально подходит для секвенирования de novo, повторного секвенирования и окончательной обработки ПЦР-продуктов, плазмид, фосмид и шаблонов BAC-клонов.

Преимущества набора BigDye Terminator v3,1 Cycle Sequencing Kit

• Оптимизирован под длинные ряды;
• улучшенные характеристики подвижности красителя;
• улучшенная производительность считывания ГТ-богатых участков.

Применение набора BigDye Terminator v3,1 Cycle Sequencing Kit

Секвенирование с высоким содержанием AT (>65%), сравнительное секвенирование (герминальные мутации — 50:50), секвенирование с высоким содержанием GC (>65%), обнаружение смешанных оснований, секвенирование с длинным считыванием, повторное секвенирование, секвенирование de novo — высокая производительность (кДНК), секвенирование с высоким содержанием GT или сложными шаблонами.

Состав набора BigDye Terminator v3,1 Cycle Sequencing Kit

• Количество реакций, шт. — 100;
• BigDye Terminator v3.1 Ready Reaction Mix (800 мкл) — 1шт.;
• M13 (-21) Primer — 1 шт.;
• pGEM Control DNA — 1 шт.;
• 5X Sequencing Buffer (1мл) — 2 шт..

Совместимость: BAC-ДНК, ДНК лямбда, геномная ДНК бактерий, однонитевая ДНК, фосмиды, ПЦР-ампликоны (50:50 гетерозиготные), плазмидная ДНК (≤15 Кб), ПЦР-амфикаты.

Пятикратный (5Х) буфер для оптимизации реакции циклического секвенирования по Сенгеру, предназначен для использования с наборами для циклического секвенирования по Сенгеру AMGene Dye v3.1, BigDye Terminator v1.1 и v3.1.

Формамид предназначен для поддержания фрагментов ДНК в денатурированном состоянии при проведении электрофореза на капиллярных генетических анализаторах различных моделей. Формамид высокодеионизованный, что обеспечивает оптимальный забор анализируемого образца ДНК в капилляр во время электрокинетической инжекции. Объем 25 мл.

Условия хранения и транспортировки: -15 - 25°С.

Гарантийный срок годности: 12 месяцев с момента производства.

• Одношаговый протокол в одной пробирке 30 минут — внесение непосредственно в продукт ПЦР;
• технология на основе ферментативной реакции — ферменты необратимо инактивируются всего за 1 минуту при 80° C;
• сохранность образцов ПЦР — 100% очистка и отсутствие потерь продуктов ПЦР, независимо от длины ампликона;
• не используются спин-колонки или магнитные частицы — значительное сокращение времени очистки и снижение потерь НК;
• обрабатываемые объемы от 5 мкл до 5 л;
• формат – пробирки.

• Одношаговый протокол в одной пробирке 5 минут — внесение непосредственно в продукт ПЦР;
• технология на основе ферментативной реакции — ферменты необратимо инактивируются всего за 1 минуту при 80° C;
• сохранность образцов ПЦР — 100% очистка и отсутствие потерь продуктов ПЦР, независимо от длины ампликона;
• не используются спин-колонки или магнитные частицы — значительное сокращение времени очистки и снижение потерь НК;
• обрабатываемые объемы от 5 мкл до 5 л;
• формат — пробирки, 8-лун. стрипы, 96-лун. планшеты.

NovaDye Terminator Cycle Sequencing Kit v3.1 (аналог BigDye)— готовый набор реагентов предназначенный для циклического секвенирования по методу Сэнгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора

• Аналог BigDye
  
• Реакционную смесь 2.5X NovaDye Terminator Mix рекомендуется разбавлять буфером 5Х Dilution NovaDye Sequencing Buffer в 2-8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительная калибровка не нужна. Флуоресцентные красители NovaDye Terminator Mix полностью совместимы с набором спектральных стандартов секвенирования BigDye Terminator v3.1 (4404312 Thermo Fisher);
• средняя длина прочтений с качеством не ниже QV20 не менее 800 п.н.;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от - 15 до - 25 °С в течении 12 месяцев.

Транспортирование: при температуре от - 15 до - 25 °С.

AMGene Dye v3.1 — готовый набор реагентов, предназначенный для циклического секвенирования по методу Сенгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора AMGene Dye v3.1

• 2.5X реакционную смесь набора рекомендуется разбавлять 5Х реакционным буфером в 2–8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции и в целях экономии реагентов;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• анализ флуоресцентно меченых продуктов, полученных с использованием набора AMGene Dye v3.1, следует проводить на генетических анализаторах, которые успешно прошли спектральную калибровку для набора красителей Z (BigDye v3.1 Applied Biosystems). Для проведения первоначальной спектральной калибровки прибора (или новой капиллярной сборки в случае с ABI 3500) следует использовать или матричный стандарт (BigDye v3.1 matrix standard) или стандарт для секвенирования (BigDye v3.1 sequencing standard). Дальнейшая работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительные калибровки при наличии уже существующей не требуются;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от -18 до -25 °С в защищенном от света месте.

Транспортирование: при температуре не выше -10 °С.

Гарантийный срок годности набора: в течении 12 месяцев с даты изготовления.

Набор для очистки BigDye XTerminator – это быстрый и простой метод очистки продуктов реакции секвенирования ДНК, который удаляет невстроенные терминаторы и соли. Очистка выполняется менее чем за 40 минут и требует менее 10 минут ручной работы.

Традиционные методы очистки, такие как осаждение этанолом, требуют добавления нескольких реагентов наряду с этапами разделения фаз и центрифугирования.

Набор для очистки BigDye XTerminator требует добавления только двух реагентов, которые можно добавлять последовательно или предварительно смешивать:

• Раствор XTerminator — удаляет не включенные терминаторы красителя и свободные соли из реакции после секвенирования;
• раствор SAM — повышает эффективность раствора XTerminator и стабилизирует реакции доочистки.