Отличное решение для капиллярного секвенирования: альтернативные реагенты и пластик

Анодный буфер представлен готовым рабочим 1× раствором для проведения капиллярного электрофореза с использованием генетических анализаторов Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer и Applied Biosystems 3500xl Genetic Analyzer.

Набор содержит «Буфер-СЕ Анодный» для заполнения оригинального анодного контейнера от прибора. «Буфер-СЕ Анодный» обеспечивает процесс проведения капиллярного электрофореза.

Для заполнения контейнера в него переносят 45 мл раствора (1 флакон) «Буфер-СЕ Анодный». Внесение раствора в контейнер рекомендуется производить с помощью одноразового медицинского шприца из комплекта.

Набор рассчитан на четыре цикла замены анодного буфера в приборе.

В состав набора по запросу могут быть включены RFID-метки на клейкой подложке для считывания информации программным обеспечением: 3500 Series Data Collection Software v1.0, v3.1, v4.0.

Состав упаковки:

• «Буфер-СЕ Анодный», флакон/45 мл, шт. — 4;
• RFID-метка на клейкой подложке, шт. — 4 (по запросу);
• шприц медицинский одноразовый, шт. — 1.

Условия хранения и транспортировки:

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• остаточный срок годности при поставке не менее 5 месяцев.

Катодный буфер представлен готовым рабочим 1× раствором для проведения капиллярного электрофореза с использованием генетических анализаторов Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer и Applied Biosystems 3500xl Genetic Analyzer.

Набор содержит «Буфер-СЕ Катодный А» и «Буфер-СЕ Катодный В» для заполнения двух отдельных отсеков оригинального катодного контейнера от прибора. «Буфер-СЕ Катодный А» обеспечивает процесс проведения капиллярного электрофореза, «Буфер-СЕ Катодный В» осуществляет промывку капилляра и сбор отработанного полимера между инъекциями.

Для заполнения контейнера 45 мл раствора (1 флакон) «Буфер-СЕ Катодный А» переносят в левый отсек и 45 мл (1 флакон) раствора «Буфер-СЕ Катодный В» в правый отсек. Внесение растворов в контейнер рекомендуется производить с помощью одноразового медицинского шприца из комплекта последовательно «Буфер-СЕ Катодный А», «Буфер-СЕ Катодный В».

Набор рассчитан на четыре цикла замены катодного буфера в приборе.

В состав набора по запросу могут быть включены RFID-метки на клейкой подложке для считывания информации программным обеспечением: 3500 Series Data Collection Software v1.0, v3.1, v4.0.

Состав упаковки:

• «Буфер-СЕ Катодный А», флакон/45 мл, шт. — 4;
• «Буфер-СЕ Катодный В», флакон/45 мл, шт. — 4;
• RFID-метка на клейкой подложке, шт. — 4 (по запросу);
• шприц медицинский одноразовый, шт. — 1.

Условия хранения и транспортировки:

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• остаточный срок годности при поставке не менее 5 месяцев.

Раствор предназначен для однократной заливки и промывки полимерного насоса между сменами типа полимера и выключением прибора. Используется в качестве промывочного раствора для генетических анализаторов Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer и Applied Biosystems 3500xl Genetic Analyzer.

Основные характеристики раствора

• Объем, мл — 22±0,5;
• pH раствора — 6,0−6,5.

Условия хранения и транспортировки:

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• срок годности 9 месяцев.

Предназначен для поддержания фрагментов ДНК в денатурированном состоянии при проведении электрофореза на капиллярных генетических анализаторах.

Основные характеристики формамида-СЕ

• Объем, мл — 5 и 25;
• хранение и транспортировка при температуре, °С — от -15 до -25.

AMGene Dye v3.1 — готовый набор реагентов, предназначенный для циклического секвенирования по методу Сенгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора AMGene Dye v3.1

• 2.5X реакционную смесь набора рекомендуется разбавлять 5Х реакционным буфером в 2–8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции и в целях экономии реагентов;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• анализ флуоресцентно меченых продуктов, полученных с использованием набора AMGene Dye v3.1, следует проводить на генетических анализаторах, которые успешно прошли спектральную калибровку для набора красителей Z (BigDye v3.1 Applied Biosystems). Для проведения первоначальной спектральной калибровки прибора (или новой капиллярной сборки в случае с ABI 3500) следует использовать или матричный стандарт (BigDye v3.1 matrix standard) или стандарт для секвенирования (BigDye v3.1 sequencing standard). Дальнейшая работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительные калибровки при наличии уже существующей не требуются;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от -18 до -25 °С в защищенном от света месте.

Транспортирование: при температуре не выше -10 °С.

Гарантийный срок годности набора: в течении 12 месяцев с даты изготовления.

NovaDye Terminator Cycle Sequencing Kit v3.1 (аналог BigDye)— готовый набор реагентов предназначенный для циклического секвенирования по методу Сэнгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора

• Аналог BigDye;
• реакционную смесь 2.5X NovaDye Terminator Mix рекомендуется разбавлять буфером 5Х Dilution NovaDye Sequencing Buffer в 2-8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительная калибровка не нужна. Флуоресцентные красители NovaDye Terminator Mix полностью совместимы с набором спектральных стандартов секвенирования BigDye Terminator v3.1 (4404312 Thermo Fisher);
• средняя длина прочтений с качеством не ниже QV20 не менее 800 п.н.;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от - 15 до - 25 °С в течении 12 месяцев.

Транспортирование: при температуре от - 15 до - 25 °С.

96-луночные планшеты от компании ABclonal для ПЦР и количественной ПЦР произведены с соблюдением высоких стандартов. Стенка лунок тонкая и однородная по всему периметру, что делает передачу тепла более эффективной, а образец нагревается более гомогенно. Благодаря усовершенствованной конструкции пресс-формы и процессу литья под давлением планшеты для ПЦР обладают более высокой механической стабильностью и низкой адсорбцией, что увеличивает точность полученных результатов.

Характеристики планшета для ПЦР

• Рабочий объём лунки, мл — 0,2;
• низкий профиль;
• угол среза A12;
• с полуюбкой;
• цвет — прозрачный матовый;
• буквенно-цифровая нумерация лунок;
• ультра чистый полипропилен;
• сертифицированы на отсутствие ДНКаз, РНКаз, человеческой ДНК, пирогенов, тяжелых металлов.

Планшеты с полуюбкой на 96 лунок PCR-P-96-10 сконструированы для приборов Applied Biosystems.

Технические характеристики планшета для ПЦР

• Рабочий объём лунки, мл — 0,2;
• стандартный профиль;
• стенки толщиной, мм — 0,3 - 0,35;
• полуюбка;
• цвет — прозрачный;
• буквенно-цифровая нумерация лунок;
• материал — ультрачистый полипропилен;
• сертификат отсутствия ингибиторов ПЦР, ДНК человека, РНКаз, ДНКаз, эндотоксинов;
• нестерильные;
• возможно делать термообработку автоклавированием в условиях 121 °C, 15 мин.

Силиконовая закрывающая прокладка. Предназначена для закрывания 96-луночных планшетов при проведении капиллярного электрофореза на генетических анализаторах 3130, 3130XL, 3730XL, 3500, 3500XL, SeqStudio, Нанофор 05.

20 штук в упаковке.

Силиконовая закрывающая прокладка. Предназначена для закрывания отдельных лунок стрипов и 96-луночных планшетов при проведении капиллярного электрофореза на генетических анализаторах 3130, 3130XL, 3730XL, 3500, 3500XL, SeqStudio, Нанофор 05.

500 штук в упаковке.

8-капиллярная сборка для генетического анализатора G08 (также может использоваться в генетических анализаторах 3500 Applied Biosystems). Длина капилляров 36 см. Рекомендуется для проведения секвенирования по Сенгеру с длиной прочтений до 600-700 п.н и фрагментного анализа с длиной фрагментов до 600 п.н.

16-капиллярная сборка для генетического анализатора G16 (также может использоваться в генетических анализаторах 3130xl Applied Biosystems, A16 Genetic Analyser). Длина капилляров 36 см. Рекомендуется для проведения секвенирования по Сенгеру с длиной прочтений до 600-700 п.н и фрагментного анализа с длиной фрагментов до 600 п.н.

24-капиллярная сборка для генетического анализатора G24 (также может использоваться в генетических анализаторах 3500xl Applied Biosystems). Длина капилляров 36 см. Рекомендуется для проведения секвенирования по Сенгеру с длиной прочтений до 600-700 п.н и фрагментного анализа с длиной фрагментов до 600 п.н.

8-капиллярная сборка для генетического анализатора G08 (также может использоваться в генетических анализаторах 3500 Applied Biosystems). Длина капилляров 50 см. Рекомендуется для проведения секвенирования по Сенгеру с длиной прочтений до 900 п.н и фрагментного анализа с длиной фрагментов свыше 600 п.н.

16-капиллярная сборка для генетического анализатора G16 (также может использоваться в генетических анализаторах 3130xl Applied Biosystems, A16 Genetic Analyser). Длина капилляров 50 см. Рекомендуется для проведения секвенирования по Сенгеру с длиной прочтений до 900 п.н и фрагментного анализа с длиной фрагментов свыше 600 п.н.

24-капиллярная сборка для генетического анализатора G24 (также может использоваться в генетических анализаторах 3500xl Applied Biosystems). Длина капилляров 50 см. Рекомендуется для проведения секвенирования по Сенгеру с длиной прочтений до 900 п.н и фрагментного анализа с длиной фрагментов свыше 600 п.н.

Полимер «Восток-4» — полимерная матрица, оптимизированная для фрагментного анализа и быстрого секвенирования коротких фрагментов ДНК. По своим характеристикам вязкости и разрешающей способности полностью сопоставим с полимером POP-4 (Applied Biosystems).

Полимер «Восток-4» работает на стандартных протоколах и настройках генетических анализаторов с длиной капиллярной сборки 36 см и полностью совместим с системами Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer, Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer, Honor-1616/1816 Genetic Analyzer, Нанофор-05.

Объем полимера: составляет 3,5 и 7 мл (для анализа 384 и 960 образцов) и поставляется в специализированном для приборов флаконе.

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• остаточный срок годности при поставке не менее 6 месяцев.

Полимер «Восток-4» — полимерная матрица, оптимизированная для фрагментного анализа и быстрого секвенирования коротких фрагментов ДНК. По своим характеристикам вязкости и разрешающей способности полностью сопоставим с полимером POP-4 (Applied Biosystems).

Полимер «Восток-4» работает на стандартных протоколах и настройках генетических анализаторов с длиной капиллярной сборки 36 см и полностью совместим с системами Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer и Applied Biosystems 3500xl Genetic Analyzer.

Полимер поставляется в специализированной упаковке/пакете на 384 и 960 реакций с радиочастотной (RFID) меткой для считывания информации программным обеспечением: 3500 Series Data Collection Software v1.0, v3.1, v4.0.

Условия хранения и транспортировки:

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• остаточный срок годности при поставке не менее 6 месяцев.

Полимер «Восток-7» — универсальная полимерная матрица, оптимизированная для фрагментного анализа и секвенирования фрагментов ДНК. По своим характеристикам вязкости и разрешающей способности полностью сопоставим с полимером POP-7 (Applied Biosystems).

Полимер «Восток-7» работает на стандартных протоколах и настройках генетических анализаторов с длиной капиллярной сборки 36 см или 50 см и полностью совместим с системами Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer и Applied Biosystems 3500xl Genetic Analyzer.

Полимер поставляется в специализированной упаковке/пакете на 384 и 960 реакций с радиочастотной (RFID) меткой для считывания информации программным обеспечением: 3500 Series Data Collection Software v1.0, v3.1, v4.0.

Условия хранения и транспортировки:

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• остаточный срок годности при поставке не менее 6 месяцев.

Полимер «Восток-7» — полимерная матрица, оптимизированная для фрагментного анализа и секвенирования фрагментов ДНК. По своим характеристикам вязкости и разрешающей способности полностью сопоставим с полимером POP-7 (Applied Biosystems).

Полимер «Восток-7» работает на стандартных протоколах и настройках генетических анализаторов с длиной капиллярной сборки 36 см и 50 см и полностью совместим с системами Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer, Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer, Honor-1616/1816 Genetic Analyzer, Нанофор-05.

Объем полимера: составляет 3,5 и 7 мл (для анализа 384 и 960 образцов) и поставляется в специализированном для приборов флаконе.

Условия хранения и транспортировки:

• хранение и транспортировка при температуре, °С — 2-8;
• остаточный срок годности при поставке не менее 6 месяцев.