Геномика — новая нефть. Узнайте, как ее добывать 23 октября в секции NGS-секвенирование на МК Диаэм!

S100 — это настольный секвенатор, отличающийся компактным размером, интуитивно понятным управлением, высокой точностью секвенирования, гибкостью адаптации к различным сценариям и широким спектром выполняемых задач. Единственный прибор для массового параллельного секвенирования, в котором внедрен алгоритм коррекции ошибок (Error Correction Code), что позволяет повысить точность секвенирования в 10 раз.

Генерации кластеров ДНК и секвенирование осуществляются в одном приборе, без выполнения ручных операций. Два режима секвенирования: сверхбыстрый (BitSeq), подходящий для определения количественной структуры цепи (делеции, дупликации, небольшие CNV) и сверхточный (ECC), подходящий и для детекции низкочастотных вариантов.

Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные применения секвенатора S100

• Таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
• секвенирование транскриптомов;
• метагеномное секвенирование;
• детекция низкочастотных вариантов;
• анализ степени метилирования ДНК;
• анализ ДНК-белковых взаимодействий;
• секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
• НИПТ, ПГТ-А;
• секвенирование экзома;
• полноэкзомное секвенирование.

Характеристики секвенатора S100

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 1;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн — 100 и 200;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб — 30;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов —150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• совместимость с библиотеками для секвенирования на платформах Illumina, Ion Torrent;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q40) больше 80% оснований с точностью прочтения 99,99%;
• требования к сети — 220 В; 50 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 550×650×650;
• вес инструмента, кг ≤ 80.

Комплектация:

• секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК (Операционная система — Windows 10 Pro, CPU：2,4 GHz*2. Память: 128 GB; Hard Disk 1 TB;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

PolyseqOne — это портативная система нанопорового секвенирования средней производительности, позволяющая проводить анализ в режиме реального времени. Компания Polyseq Biotechnology разработала собственные нанопоровые белки, наборы для подготовки библиотек и секвенирования, конструкцию чипа, программную инженерию и алгоритмы глубокого обучения.

Нанопоровые белки закреплены на полимерной мембране, которая окружена электролитным раствором с обеих сторон. Ионы электролита проходят через нанопору, создавая постоянный электрический ток. Молекулы ДНК или РНК обладают электрическим зарядом, и под действием электрического поля одноцепочечные молекулы проходят через нанопору от отрицательно заряженной стороны (cis) к положительно заряженной (trans). Поскольку размер и заряд нуклеотидов различаются, ток через пору изменяется (возникают флуктуации). Эти колебания регистрируются и с помощью распознавания паттернов преобразуются в последовательность ДНК.

Основные применения нанопорового секвенатора Polyseq One

• Полногеномное секвенирование (WGS). Например, прочтение от теломеры к теломере (T2T), включая сложные регионы (повторы, центромеры).
• Структурные вариации. Детекция крупных делеций, инверсий, дупликаций.
• Прямое секвенирование РНК.
• Выявление редких транскриптов и клеточных субпопуляций.
• Сборка полных геномов бактерий из сложных образцов.
• Разделение метагеномных данных на отдельные геномы.
• Детекция эпигенетических изменений.
• Экологический мониторинг.
• Сборка сложных полиплоидных геномов.

Характеристики нанопорового секвенатора Polyseq One

• Точность одного прочтения, % — 97;
• длина прочтений, Kb — ≥300;
• консенсусная точность (50×), % — 99,99;
• количество пор на чипе — 2560;
• возможность использовать чип повторно — до 5 раз;
• скорость прочтения, нуклеотидов/с — 400;
• максимальный расчетный объем получаемых данных, Гб — 60;
• реальный объем получаемых данных, Гб — 30;
• адаптивное секвенирование;
• время работы, ч — до 96;
• наборы для подготовки библиотек, секвенирования, баркодирования;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 180×130×80;
• вес инструмента, кг — 1,5.

Комплектация нанопорового секвенатора Polyseq One

• Cеквенатор;
• программное обеспечение на носителе;
• проточная ячейка;
• набор для построения библиотек;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

Генетический анализатор G24 — 24-капиллярный прибор из новейшей серии капиллярных генетических анализаторов китайской компании Генные технологии здоровья. Прибор позволяет проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК, полученных в ходе реакции циклического секвенирования по Сэнгеру либо фрагментный анализ ДНК после ПЦР, рестриктазного расщепления и других методов молекулярной генетики.

Принципиально прибор выполнен по «открытой» схеме использования расходных материалов и не предполагает RFID-идентификации расходки. Таким образом на нем можно использовать полимеры во флаконах и буфер для электрофореза различных производителей.

Ключевым отличием данной серии от других генетических анализаторов является двухлучевая оптоволоконная система передачи оптического сигнала, которая в отличие от стандартной (зеркально-линзовой) схемы требует меньших усилий по сервисному обслуживанию, настройке и юстировке приборов, а также способствует повышению однородности сигнала.

Характеристики генетического анализатора G24

• Количество капилляров в блоке — 24;
• диапазон напряжения, кВ — 0-20;
• тип лазера — твердотельный;
• мощность лазера, мВт — 50;
• длина волны лазера, нм — 505;
• диапазон флуоресцентной детекции, нм — 522-650;
• количество одновременно детектируемых красителей — 8;
• вместимость автосэмплера — два 96-луночных планшета;
• используемые капилляры, см — 36 и 50;
• формат файлов — .fsa/.abi
• обязательное подключение к ПК;
• габариты (Ш×Г×В), мм — 710×610×820;
• вес — 105 кг;
• гарантийный срок — 1 год.

Комплект поставки:

• генетический анализатор;
• компьютер с управляющим ПО;
• набор принадлежностей;
• капиллярная сборка;
• инсталляционный набор расходных материалов (полимер, буфер, формамид).

Система капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.

Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.

• Автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
• несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
• время анализа одного образца, размером до 1 кб — от 2 до 7 минут;
• разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
• чувствительность — от 5 пг/мкл;
• объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
• визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.

• Связь с ПК — USB;
• источник возбуждения флуоресценции — светодиодный, 525 нм (зелёный);
• детекция флуоресценции, нм — 590;
• количество капилляров в картридже: 1;
• ток разделения, кВ — 1-15;
• габариты, Г × В × Ш, см — 38 х 40 х 30.

• Скрининг ПЦР-продуктов;
• генотипирование;
• количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
• анализ фрагментированности геномной ДНК;
• анализ внеклеточной ДНК;
• анализ продуктов рестриктазного расщепления;
• анализ олигонуклеотидов;
• оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
• электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).

Комплект поставки: Qsep100: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 1-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.

Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep100

Электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов). В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

Модель EzDrop 1000С имеет встроенный интуитивно понятный 7-дюймовый цветной ЖК-дисплей высокой четкости с емкостной сенсорной панелью. Прибор не требует калибровки. Время измерения всего 3 секунды, что существенно повышает производительность анализа. В измерительном отсеке имеется вспомогательная светодиодная подсветка, что помогает определить положение окна пробы и проверить пузырек пробы. Слой наногидрофобного покрытия на окошке образца обеспечивает формирование столбца образца. Конструкция подушки на манипуляторе обнаружения снижает ударную нагрузку, что, в свою очередь, снижает количество ошибок в экспериментах.

Особенности спектрофотометра EzDrop 1000С

• Время измерения 3 секунды;
• наличие кюветного отделения;
• встроенные программы измерения концентрации нуклеиновых кислот и белков, кинетика, сканирование полного спектра — всего 10 приложений;
• интуитивно понятный и простой в использовании графический интерфейс;
• вспомогательная подсветка рабочего отсека;
• наногидрофобное покрытия на окошке образца;
• ударопрочная подушка на манипуляторе обнаружения.

Технические характеристики спектрофотометра EzDrop 1000С

• рабочий объём образца, мкл — 1;
• длина оптического пути (определяется автоматически), мм — 0,5/0,05;
• время измерения, с — 3;
• источник света — ксеноновая лампа;
• детектор — CMOS линейный сенсор, 2048 элементов;
• дипазон измерения, нм — 190-1000;
• точность длины волны, нм — ±1,0
• разрешение, нм — 1,5;
• диапазон абсорбции, A — 0,04-30/20-400;
• предел обнаружения, нг/мкл DNA — 2-20000;
• предел обнаружения, мг/мл BSA — 0,06-600.

• длина пути оптического пути, мм — 0,1, 0,125, 0,2, 0,5, 1, 2, 5, 10;
• диапазон абсорбции, A — 0,002-1,5;
• предел обнаружения, нг/мкл DNA — 0,3-75;
• предел обнаружения, мг/мл BSA — 0,003-2,25;
• перемешивание — 8 скоростей;
• температурный контроль, °C — от +37 до +45;
• встроенное программное обеспечение;
• цветной сенсорный экран совместимый с перчатками — 7 дюймов;
• габариты основы, Ш×Г×В, мм — 206×333×166;
• вес, кг — 3,3.

Автоматизированные станции GenePure Pro используются для выделения НК с помощью магнитных частиц.

Линейка GenePure Pro представлена станциями с возможностью подготовки до 16, 32 и 96 образцов за один запуск. Компактные размеры, невысокий вес и современный дизайн станций позволит решать рутинные задачи лабораториям с невысокой площадью, а также безопасно воспроизводить протоколы пробоподготовки в ламинарном шкафу или боксе биологической безопасности.

Станции GenePure Pro оснащены встроенным ПО с интуитивно понятным интерфейсом, управление станциями происходит с помощью сенсорного дисплея. Станции дополнительно могут оснащаться сканером штрих-кодов, что также позволит исключить ошибки пользователя в процессе пробоподготовки. Станции GenePure Pro являются открытыми для использования магнитных частиц и реагентов различных производителей.

Станция NPA-32P предназначена для одновременного подготовки до 32 образцов за один запуск, за время от 8 до 45 минут. Производительность станции GenePure Pro (NPA-32P) может быть увеличена до 48 объектов путем смены внутреннего блока.

Основные характеристики и особенности станции GenePure Pro NPA-32P

• Одновременная подготовка до 32 образцов (до 48 образцов при модернизации станции) за один запуск;
• возможность использования протоколов выделения и очистки в объемах от 20 мкл до 1 мл;
• встроенный нагревательный блок до + 120 °С с точностью поддержания температуры ±1 °С;
• наличие встроенной УФ-лампы для деконтаминации;
• рекомендуемый диаметр магнитных частиц, мкм – от 0,2 до 1,0;
• совместимые расходные материалы – глубоколуночный планшет на 96 лунок, гребенка для 8 магнитных стержней;
• наличие USB разъема;
• размеры станции (Д × Ш × В), мм – 430 × 395 × 435;
• вес станции, кг – 32,5.

Амплификатор TurboCycler 3 (аналог ДНК-амплификатор Veriti ProFlex) имеет три независимых градиентных термоблока по 48 лунок. Градиент направлен вертикально относительно термоблока. Папка с данными пользователя защищена паролем. Имеется функция расчета температур плавления праймеров, конвертор концентрации ДНК в количество копий, калькулятор объема реагентов для приготовления мастермикса. В случае отключения электричества прибор автоматически перезапускается.

Особенности амплификатора TurboCycler 3

• Три независимых термоблока по 48 лунок;
• возможность проведения ПЦР в пробирках объемом, мл — 0,2/0,1;
• вертикально направленный градиент в каждом термоблоке;
• большой цветной сенсорный дисплей (10,1 дюймов).

Характеристики амплификатора TurboCycler 3

• Реакционный блок, мл — 3×48×0,2/0,1 (пробирки, стрипы, планшеты без юбки и с полуюбкой);
• максимальная скорость нагрева, °С/сек — 5;
• максимальная скорость охлаждения, °С/сек — 3;
• регулируемая скорость нагрева термоблоков, °С/сек — 0,1-5;
• диапазон температурного градиента, °С — 30 (в пределах 30-100 °С);
• диапазон нагрева термоблоков, °С — 4-100;
• диапазон нагрева крышки, °С — 35-120 (с возможностью отключения);
• точность поддержания температуры блоков, °С — ±0,3;
• гомогенность температуры блока, °С — ±0,4;
• гомогенность температуры крышки, °С — ±1;
• количество протоколов в памяти — 4000;
• интерфейс с ПК — USB;
• потребляемая мощность, Вт — 1000;
• габариты (Ш×Г×В), мм — 240×340×340;
• масса, кг — 13.