Мастер-микс ChamQ Geno-SNP Probe специально разработан для генотипирования однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) с помощью реал-тайм ПЦР на основе флуоресцентно-меченных зондов. Мастер-микс ChamQ Geno-SNP Probe — это готовая к использованию 2-кратная смесь, содержащая ДНК-полимеразу с «горячим» стартом Champagne Taq, смесь dNTP и оптимизированный буферный раствор, а также систему защиты от загрязнения и специальный эталонный краситель ROX. Система защиты от загрязнения работает при комнатной температуре, что исключает загрязнение продуктов амплификации и обеспечивает точность генотипирования SNP. Специальный эталонный краситель ROX подходит для всех моделей ДНК-амплификаторов "в реальном времени", концентрацию ROX не нужно корректировать на различных моделях приборов. ДНК-полимераза с «горячим» стартом Champagne Taq с оптимизированной буферной системой увеличивает частоту успешного генотипирования SNP из низкоконцентрированных и сложных образцов. Для проведения ПЦР необходимо добавить в реакционную смесь праймеры, флуоресцентно-меченные зонды и матрицу.

Компоненты мастер-микса:

*Состав мастер-микса ChamQ Geno-SNP Probe: смесь dNTPs, MgCl²⁺, ДНК-полимераза с «горячим» стартом Champagne Taq, специальный эталонный краситель ROX.

Генетический анализатор 3500 — это 8-капиллярный прибор, который может использоваться для широкого спектра задач, включая секвенирование de novo и ресеквенирование (мутационное профилирование), а также микросателлитный анализ, MLPA, LOH, MLST и валидацию или скрининг SNP. Большинство из этих приложений может быть выполнено на одном типе полимера и капиллярной сборке одной длины.

Генетические анализаторы серии 3500 были разработаны более 15 лет назад и по настоящее время являются непревзойденными по качеству получаемых данных и удобству использования приборами и являют собой эталон в данной области приборостроения.

Серия 3500 использует готовые расходные материалы с предварительно упакованными полимерными пакетами, катодными и анодными буферными контейнерами и легко устанавливаемыми капиллярными сборками. Каждый из этих расходных материалов оснащен RFID-метками, которые позволяют просматривать, отслеживать и сообщать важную информацию о реагентах и расходных материалах, включая данные об использовании, номере партии, номере детали, сроке годности и сроке службы на приборе, в программном обеспечении для сбора данных Data Collection.

Программное обеспечение для сбора данных Data Collection отличается удобной навигацией: интуитивно понятный дизайн приборной панели, хорошо заметные кнопки для выполнения общих операций, легко читаемые графические дисплеи для контроля состояния расходных материалов, а также удобный календарь планирования технического обслуживания. Функциональные возможности этого ПО включают упрощенную настройку планшетов и встроенный первичный анализ с контролем качества, что позволяет принимать решения о качестве данных по мере их получения на приборе без необходимости передачи выходных файлов в программные пакеты вторичного анализа.

Характеристики генетического анализатора 3500

• Количество капилляров в блоке — 8;
• лазерный источник света;
• длина волны, нм — 505;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• формат планшет — 96 или 384 лунки;
• производительность за запуск, п.н. — 3,2-8,0×10³;
• система контроля и оптимизации расхода полимера;
• кассеты с РОР полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
  • на 96 образцов (12 инъекций);
  • на 384 образца (60 инъекций);
  • на 960 образов (120 инъекций);
• обязательное подключение к ПК;
• расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
• индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
• мощность (без компьютера), Вт — 271;
• габариты, Ш×Г×В, мм — 610×610×720;
• вес, кг — 82.

Комплект поставки: генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.

Генетический анализатор 3500xL — это 24-капиллярный прибор, который может использоваться для широкого спектра задач, включая секвенирование de novo и ресеквенирование (мутационное профилирование), а также микросателлитный анализ, MLPA, LOH, MLST и валидацию или скрининг SNP. Большинство из этих приложений может быть выполнено на одном типе полимера и капиллярной сборке одной длины.

Генетические анализаторы серии 3500 были разработаны более 15 лет назад и по настоящее время являются непревзойденными по качеству получаемых данных и удобству использования приборами и являют собой эталон в данной области приборостроения.

Серия 3500 использует готовые расходные материалы с предварительно упакованными полимерными пакетами, катодными и анодными буферными контейнерами и легко устанавливаемыми капиллярными сборками. Каждый из этих расходных материалов оснащен RFID-метками, которые позволяют просматривать, отслеживать и сообщать важную информацию о реагентах и расходных материалах, включая данные об использовании, номере партии, номере детали, сроке годности и сроке службы на приборе, в программном обеспечении для сбора данных Data Collection.

Программное обеспечение для сбора данных Data Collection отличается удобной навигацией: интуитивно понятный дизайн приборной панели, хорошо заметные кнопки для выполнения общих операций, легко читаемые графические дисплеи для контроля состояния расходных материалов, а также удобный календарь планирования технического обслуживания. Функциональные возможности этого ПО включают упрощенную настройку планшетов и встроенный первичный анализ с контролем качества, что позволяет принимать решения о качестве данных по мере их получения на приборе без необходимости передачи выходных файлов в программные пакеты вторичного анализа.

Характеристики генетического анализатора 3500xL

• Количество капилляров в блоке — 24;
• лазерный источник света;
• длина волны, нм — 505;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• формат планшет — 96 или 384 лунки;
• производительность за запуск, п.н. — 9,6-24,0×10³;
• система контроля и оптимизации расхода полимера;
• пакеты с РОР-полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
  • на 96 образцов (5 инъекций);
  • на 384 образца (20 инъекций);
  • на 960 образов (50 инъекций);
• обязательное подключение к ПК;
• расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
• индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
• мощность (без компьютера), Вт — 271;
• габариты, Ш×Г×В, мм — 610×610×720;
• вес, кг — 82.

Комплект поставки: генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.

Набор SC WGA Display обеспечивает высококачественную полногеномную амплификацию малого количества ДНК (от 15 пг), выделенной из единичных клеток, с выходом 1 — 2 мкг продукта. Амплификация ДНК проводится в одной пробирке в одну стадию с использованием несложного протокола. Методом полногеномной амплификации является улучшенная версия дегенеративной олиго-ПЦР (DOP-PCR). Ключевой компонент набора уникальный инновационный фермент — SD ДНК-полимераза позволяет амплифицировать фрагменты в диапазоне 0,25 – 3 kb, а также обеспечивает высокую скорость процесса.

Отличается от набора WGA Display наличием в составе буфера и фермента для лизиса единичных клеток.

Области использования набора SC WGA Display

Продукт амплификации, полученный с помощью набора реагентов, может быть использован для следующих видов анализа:

• анализ ДНК, выделенной из единичных клеток (Single cell DNA analysis);
• анализ вариации числа копий (Copy Number Variation (CNV) analysis);
• анализ методом массового параллельного секвенирования (Next Generation Sequencing (NGS) analysis);
• анализ однонуклеотидных полиморфизмов (Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Genotyping);
• анализ коротких тандемных повторов (Short Tandem Repeat (STR) analysis) и полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) analysis);
• анализ методом сравнительной геномной гибридизации (Comparative Genomic Hybridization (CGH)).

Преимущества набора SC WGA Display

• Минимальное количество исходного материала ДНК, пг – от 15;
• амплификация в одну стадию в одной пробирке;
• высокая воспроизводимость;
• длина получаемых фрагментов, п.н. – 250-3000;
• универсальность использования ампликонов: микрочипы (CGH), NGS на различных платформах, ПЦР (Real-Time и Digital).

Состав набора

Наименование реагента	Пробирка, шт.	Цвет крышки пробирки		Номинальный объем, мкл
				На 8 реакций	На 24 реакции	На 96 реакций
2,5x ММ (мастер-микс)	1		Фиолетовый	165	300	1100
SD ДНК-полимераза	1		Красный	33	60	212
Контрольная ДНК, 50 нг/мкл	1		Зеленый	30	30	30
Буфер для лизиса клеток	1		Желтый	38	68	248
Фермент для лизиса клеток	1		Оранжевый	15	27	99
5х ПЦР смесь	1		Прозрачный	75	135	495
Taq ДНК-полимераза	1		Синий	15	27	99
50x SYBR green	1		Черный	8	14	50
Вода для ПЦР	N*		Белый	1400	1400	1400

* – Для наборов на 12 реакций N = 1, на 24 и 96 реакций N = 2.

Хранение компонентов набора: от - 18 до - 20 °С в течении 12 месяцев.

Транспортирование: при температуре не выше - 18 °С.

Набор WGA Display обеспечивает высококачественную полногеномную амплификацию малого количества ДНК (от 15 пг) с выходом 1 — 2 мкг продукта. Амплификация ДНК проводится в одной пробирке в одну стадию с использованием несложного протокола. Методом полногеномной амплификации является улучшенная версия дегенеративной олиго-ПЦР (DOP-PCR). Ключевой компонент набора уникальный инновационный фермент — SD ДНК-полимераза позволяет амплифицировать фрагменты в диапазоне 0,25 – 3 kb, а также обеспечивает высокую скорость процесса.

Области использования набора WGA Display

Продукт амплификации, полученный с помощью набора реагентов, может быть использован для следующих видов анализа:

• анализ ДНК, выделенной из единичных клеток (Single cell DNA analysis);
• анализ вариации числа копий (Copy Number Variation (CNV) analysis);
• анализ методом массового параллельного секвенирования (Next Generation Sequencing (NGS) analysis);
• анализ однонуклеотидных полиморфизмов (Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Genotyping);
• анализ коротких тандемных повторов (Short Tandem Repeat (STR) analysis) и полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) analysis);
• анализ методом сравнительной геномной гибридизации (Comparative Genomic Hybridization (CGH)).

Преимущества набора WGA Display

• Минимальное количество исходного материала ДНК, пг – от 15;
• амплификация в одну стадию в одной пробирке;
• высокая воспроизводимость;
• длина получаемых фрагментов, п.н. – 250-3000;
• универсальность использования ампликонов: микрочипы (CGH), NGS на различных платформах, ПЦР (Real-Time и Digital).

Состав набора

Наименование реагента	Пробирка, шт.	Цвет крышки пробирки		Номинальный объем, мкл
				На 8 реакций	На 24 реакции	На 96 реакций
2,5x ММ (мастер-микс)	1		Фиолетовый	165	300	1100
SD ДНК-полимераза	1		Красный	33	60	212
Контрольная ДНК, 50 нг/мкл	1		Зеленый	30	30	30
5х ПЦР смесь	1		Прозрачный	75	135	495
Taq ДНК-полимераза	1		Синий	15	27	99
50x SYBR green	1		Черный	8	14	50
Вода для ПЦР	N*		Белый	1400	1400	1400

* – Для наборов на 12 реакций N = 1, на 24 и 96 реакций N = 2.

Хранение компонентов набора: от - 18 до - 20 °С в течении 12 месяцев.

Транспортирование: при температуре не выше - 18 °С.

• хромосомный микроматричный анализ позволяет обнаружить:
• вариации числа копий ДНК (CNV) всего генома, включая:
• микроделеции/микродупликации размером от 1 тыс. п.н. до млн. п.н (и точное определение их генного состава);
• анеуплоидии;
• несбалансированные транслокации;
• точное определение точек разрыва;
• мозаицизм;
• нарушение плоидности;
• участки потери гетерозиготности (LoH), включая копий-нейтральные участки потери гетерозиготности (cnLoH);
• хромотрипсис;
• определить точечные полиморфизмы (SNP);
• выявить частые мутации в генах;
• определить видовую принадлежность ДНК;
• провести анализ экспрессии генов.

• в пренатальной диагностике для поиска хромосомной патологии плода;
• в постанальной диагностике для детей со множественными пороками развития, задержкой развития, аутизмом;
• для анализа постабортного материала для установления причины потери беременности;
• в онкологии для исследования опухолевых клеток.

• идентификация и паспортизизация сорта и породы сельскохозяйственных растений и животных;
• ДНК-скрининг селекционных маркеров при скрещивании и выявлении наследуемых патологий.

• сканер GeneChip Scanner 3000 7G;
• промывочные станции Fluidics Station 450;
• гибридизационную печь Hybridization Oven 645.

• Chromosome Analysis Suite (ChAS): для анализа числа копий;
• Multi-Sample Viewer (MSV): для анализа числа копий и соматических мутаций у большого количесва образцов одновренменно;
• Somatic Mutation Viewer 1.1, для соматичесих мутаций;
• Nexus Express Software для анализа числа копий и соматических мутаций.

• компактный размер для лучшего использования пространства;
• сканирование с более высоким разрешением от 0,51 до 2,5 мкм пикселизации, автоматически выбираемые по типу микроматрицы;
• оптимальная однородность изображения и эффективность сбора всей области сканирования благодаря запатентованной технологии Applied Biosystems™ Flying Objective™;
• отсутствие дрейфа лазера и снижение вариабельности от сканера к сканеру;
• автоматическая регулировка коррекции остаточной дуги и x-линейности;
• совместимость с автозагрузчиком GeneChip Autoloader для самостоятельного сканирования до 48 микроматриц одновременно.

• время сканирования: 5-45 минут на один картридж в зависимости от типа микроматрицы;
• габариты, Г × В × Ш, см: 33 x 56 x 58 см, дополнительно 20 см к высоте для GeneChip AutoLoader;
• вес: 31,8 кг, 47,6 кг с GeneChip AutoLoader;
• питание: Напряжение: 100–240 В, ток: 2–4 А, частота: 50–60 Гц;
• связь с ПК: Dell™ Precision T5600XL Workstation;
• процессор: Intel™ Xeon™ Processor E5-2620;
• память: 8.0 GB;
• жесткий диск: Dual 900 GB;
• ОС: Microsoft™ Windows™ 7 Professional 64-bit;
• контроллер сетевого интерфейса: Разрабатан с предустановленными и специализированными платами для контроля GeneChip Scanner или Applied Biosystems™ GeneChip™ Fluidics Station;
• DVD: 8x max DVD-R drive and 16x max DVD-RW drive;
• видео монитор: 20 in. flat-screen LCD monitor.

В клетке могут встречаться редкие мутации, например лишь в одной из нескольких сотен клеточных митохондриальных ДНК. В общей смеси при обычном ПЦР при таком сильном разведении эти мутации невозможно обнаружить. Похожая картина нередко наблюдается в отношении минорных опухолевых мутациях. Цифровой капельный ПЦР (Droplet Digital PCR) – усовершенствованный метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), при котором реакционная смесь после добавления ДНК распыляется на множество мельчайших капель, попадающих на лунки чипа. Чип может содержать несколько десятков тысяч ячеек, на которых в каплях протекает ПЦР. При этом возможна визуализация результата реакции с каждой ячейки. По завершению реакции данный чип может быть использован для проведения секвенирования или клонирования с каждой капли.

Система QX200 Droplet Digital PCR предназначена для проведения цифровой капельной ПЦР третьего поколения, позволяющей добиться высочайшей точности и достоверности результатов. QX200 обеспечивает абсолютную количественную оценку ДНК- и РНК-мишеней как с помощью зондов так и с помощью интеркалирующего красителя EvaGreen, исключая использования калибровочных кривых .

Система включает в себя QX200 Droplet Generator (генератор микродисперсионных капель из кДНК или РНК-содержащих образцов) и QX200 Droplet Reader (позволяет осуществлять сверхчувствительный и точный автоматический анализ продуктов амплификации).

Преимущества цифрового капельного ПЦР по сравнению с RТ ПЦР:

• гибкость системы и оптимизация ее для EvaGreen и TaqMan зондов любых производителей;
• сверхчувствительность и сверхточность количественного анализа продуктов амплификации гена-мишени в каждой капле образца;
• фракционирование образцов на нанокапли сводит к минимуму влияние на результат исследований таких параметров как наличие ингибиторов ПЦР и эффективности;
• протекания амплификации за счет абсолютного подсчета гена-мишени в каждой капле;
• отсутствие необходимости использования калибровочных кривых;
• прямое обнаружение редкого варианта гена-мишени в сложном окружении.

Применения системы цифровой ПЦР QX200 Droplet Digital PCR:

• Количественная оценка биомаркеров рака. Мутациям, ассоциированным с онкологией, часто удаётся избежать детектирования из-за их низкой концентрации по сравнению с фоновой ДНК дикого типа в том же образце. За счёт высокой чувствительности система QX200 позволяет детектировать и количественно оценивать мутации в концентрациях от 0,0001% (!) - одна на сто тысяч.


• Обнаружение и оценка возбудителей заболеваний. Точная количественная оценка вирусной нагрузки крайне важна для определения состояния заболевания, разработки, утверждения и оценки эффективности терапии. QX200 обладает чувствительностью достаточной для обнаружения сверхмалых количеств вирусного генетического материала и в том числе и в сложных смесях


• Определение количества копий гена (CNV). Вариации числа копий гена (CNV) является значимым источником полиморфизма в геноме человека. CNV ассоциируется с раком, неврологическими и аутоиммунными заболеваниями, а также с побочными эффектами при воздействии лекарственных средств. QX200 позволяет определить CNV с точностью соотношения 1.2х (!), например, пять против шести.


• Валидация и количественная оценка библиотек NGS. С помощью технологии цифровой ПЦР можно качественно и количественно оценить библиотеку, что позволяет наиболее эффективно использовать секвенаторы.


• Анализ экспрессии генов. Капельная цифровая ПЦР позволяет количественно определить уровень экспрессии гена. Благодаря высокой точности и чувствительности метода возможна оценка минимального 10% (!) изменения экспрессии, в том числе и при низких концентрациях.


• Тестирование продуктов на наличие ГМО. С точностью до тысячных долей процента позволяет оценить количество генетически модифицированных ингредиентов в продуктах питания, сырье кормах.

Скачать список публикаций с использованием технологии капельной ПЦР

Скачать листовку о системе QX200 Droplet Digital PCR и её применении

QX100 и ПО ddPCR

ДНК-амплификаторы семейства QuantStudio предназначены для ля широкого диапазона различных областей исследований. Благодаря проверенной технологии Optiflex и блокам VeriFlex система QuantStudio 5 позволяет с повышенной точностью и чувствительностью решать целый спектр задач.

Области применения QuantStudio 5:

• изучение инфекционных заболеваний;
• поиск пищевых патогенов;
• поиск патогенов в воде;
• анализ фармацевтической продукции;
• исследования в области стволовых клеток;
• фармакогеномика;
• исследование онкологических и генетических заболеваний;
• сельскохозяйственная биотехнология и ботаника.

QuantStudio 5 позволяет провести целый спектр анализов:

• анализ экспрессии генов;
• анализ однонуклеотидных полиморфизмов (SNP-генотипирование);
• оценка копийности генов;
• профилирование микро РНК;
• анализ метилирования;
• анализ методом высокоразрешающего плавления (HRM)-анализ;
• детекция мутаций;
• температурный сдвиг денатурации белков;
• изучение метаболизма лекарственных средств.

Технические характеристики амплификатора QuantStudio 5:

• формат термоблока — 96×0,2 мл;
• объем реакционной смеси, мкл — 10-30;
• источник возбуждения — белый светодиод (LED);
• детектор оптический — 6 независимых фильтров;
• количество каналов измерения флуоресценции — 6;
• длина волны возбуждения, нм — 450–680;
• длина волны флуоресценции, нм — 500–730;
• совместимость с красителями — FAM/SYBR Green, VIC/JOE/HEX/TET, ABY/NED/TAMRA/Cy3, JUN, ROX/ Texas Red, Mustang Purple, Cy 5/ LIZ, Cy 5;
• исполнительное устройство термоблока — элемент Пельтье;
• градиент температур — 6 зон VeriFlex;
• гомогенность температур, °С — ±0,4;
• точность поддержания температуры, °С — ±0,25;
• максимальная скорость нагрева/охлаждения блока, °С/с — 6;
• средняя скорость нагрева/охлаждения блока, °С/с — 3,66;
• время анализа — от 30 мин;
• чувствительность — детекция различий в количестве мишеней вплоть до 1,5-кратных различий в рамках одной реакции;
• интерактивный ЖК дисплей с технологией TouchScreen;
• габариты, Ш×Г×В, мм — 270×500×400.

Комплект поставки: ДНК-амплификатор, шнур питания, инструкции.

Для семейства QuantStudio доступен пакет модулей обработки данных на платформе Connect. Это позволяет пользователям получать доступ к своим данным и обрабатывать их в любое время в любом месте.

Доступные модули для QuantStudio 5:

• планирование и проведение эксперимента;
• анализ методом высокоразрешающего плавления (HRM);
• анализ на наличие/отсутствие заданной последовательности;
• стандартная кривая — количественное определение неизвестных количеств генов, импортирование кривых из других экспериментов;
• генотипирование;
• анализ панелей экспрессии плюрипотентных стволовых клеток (ПСК) человека — оценивает профили экспрессии генов, полученные с помощью панелей hPSC TaqMan в сравнении с эталонным набором хорошо охарактеризованных линий ПСК;
• относительное количественное определение.

Товар временно недоступен. Аналоги по запросу ниже.

В клетке могут встречаться редкие мутации, например, лишь в одной из нескольких сотен клеточных митохондриальных ДНК. В общей смеси при обычном ПЦР при таком сильном разведении эти мутации невозможно обнаружить. Похожая картина нередко наблюдается в отношении минорных опухолевых мутациях. Цифровой капельный ПЦР (Droplet Digital PCR) – усовершенствованный метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), при котором реакционная смесь после добавления ДНК распыляется на множество мельчайших капель, попадающих на лунки чипа. Чип может содержать несколько десятков тысяч ячеек, на которых в каплях протекает ПЦР. При этом возможна визуализация результата реакции с каждой ячейки. По завершению реакции данный чип может быть использован для проведения секвенирования или клонирования с каждой капли.

Инновационная система QX200 Droplet AutoDG Digital PCR предназначена для проведения цифровой капельной ПЦР третьего поколения, позволяющей добиться высочайшей точности и достоверности результатов. Система включает в себя автоматический Droplet Generator (генератор микродисперсионных капель из кДНК или РНК-содержащих образцов) со встроенным цветным монитором, QX200 Droplet Reader (позволяет осуществлять сверхчувствительный и точный автоматический анализ продуктов амплификации) и Automated Droplet Generator, который автоматической загрузки образцов и дальнейшее его пипетирование на 96 луночный планшет в генераторе капель. Аппарат AutoDG имеет свой собственный кожух и фильтр НЕРА, что ведет к снижению вероятности загрязнения, поэтому система может быть использована на стандартном лабораторном столе, без необходимости применения бокса для ПЦР или чистой комнаты.

Преимущества цифрового капельного ПЦР по сравнению с RТ ПЦР:

• исключительная чувствительность;
• исключительная точность;
• отсутствие калибровочных кривых;
• прямое обнаружение редкого варианта мишени в сложном окружении;
• отсутствие эффекта первых циклов ПЦР;
• большая производительность;
• ручная работа предельно упрощена и сведена к минимуму;
• генерация капель для 96 образцов за 45 минут;
• HEPA-фильтры для снижения риска контаминации;
• цветной сенсорный экран с удобным программным обеспечением.

Применения системы цифровой ПЦР QX200 Droplet Digital PCR:

• Количественная оценка биомаркеров рака. Мутациям, ассоциированным с онкологией, часто удаётся избежать детектирования из-за их низкой концентрации по сравнению с фоновой ДНК дикого типа в том же образце. За счёт высокой чувствительности система QX200 позволяет детектировать и количественно оценивать мутации в концентрациях от 0,0001% (!) - одна на сто тысяч.


• Обнаружение и оценка возбудителей заболеваний. Точная количественная оценка вирусной нагрузки крайне важна для определения состояния заболевания, разработки, утверждения и оценки эффективности терапии. QX200 обладает чувствительностью достаточной для обнаружения сверхмалых количеств вирусного генетического материала и в том числе и в сложных смесях


• Определение количества копий гена (CNV). Вариации числа копий гена (CNV) является значимым источником полиморфизма в геноме человека. CNV ассоциируется с раком, неврологическими и аутоиммунными заболеваниями, а также с побочными эффектами при воздействии лекарственных средств. QX200 позволяет определить CNV с точностью соотношения 1.2х (!), например, пять против шести.


• Валидация и количественная оценка библиотек NGS. С помощью технологии цифровой ПЦР можно качественно и количественно оценить библиотеку, что позволяет наиболее эффективно использовать секвенаторы.


• Анализ экспрессии генов. Капельная цифровая ПЦР позволяет количественно определить уровень экспрессии гена. Благодаря высокой точности и чувствительности метода возможна оценка минимального 10% (!) изменения экспрессии, в том числе и при низких концентрациях.


• Тестирование продуктов на наличие ГМО. С точностью до тысячных долей процента позволяет оценить количество генетически модифицированных ингредиентов в продуктах питания, сырье кормах.

Этапы проведения эксперимента при использовании метода цифровой ПЦР.

Капельная цифровая ПЦР осуществляется в четыре последовательных этапа:

1. Подготовка реакционной смеси. Подготавливают 20 мкл реакционной ПЦР смеси для каждого образца, затем смесь помещают в пластиковый картридж QX200 droplet генератора.


2. Генерация капель. В соответствующие каналы картриджа заливается специальное минеральное масло, и наполненный картридж устанавливают в QX200 droplet генератор, где образцы и масло соединяются между собой по микро каналам внутри картриджа для получения эмульсии — около 20 000 монодисперсных капель для каждого из 8 подготовленных образцов. Объем каждой капли 1 нл.


3. Полимеразная цепная реакция. Эмульсионные образцы переносятся на стандартную 96-луночную плашку для ПЦР и амплифицируются с помощью стандартного термоциклера, например C1000 touch.


4. Считывание и анализ результатов. После завершения ПЦР плашка загружается в QX200 droplet ридер, который обеспечивает анализ флуоресцентного сигнала капель, детектируя каждую каплю по очереди и определяя, какие капли содержат мишень, а какие нет. Анализ результатов осуществляется с помощью программного обеспечения ddPCR.

Товар временно недоступен. Аналоги по запросу ниже.

• Формат термоблока — 96 луночный;
• источник возбуждения — вольфрамово-галогеновая лампа;
• детектор флуоресценции — ПЗС-матрица;
• количество каналов измерения флуоресценции — 5;
• длины волн возбуждения/флуоресценции, нм — 400 —700;
• термоблок — элемент Пельтье;
• диапазон температур, °С — 4–100;
• гомогенность температур не более, °С — ±0,5;
• точность поддержания температуры, °С — ±0,25;
• скорость нагрева/охлаждения, °С/сек — 2,5/2,5;
• продолжительность ПЦР, ч — 2;
• реакционный объем, мкл — 20–100;
• поставляется с ноутбуком;
• габариты, ШхГхВ, мм — 340х450х490;
• вес, кг — 34.

Пять фильтров для работы в широком диапазоне флуорофоров: Fam/Sybr Green I, Vic/Joe, Tamra/Ned/Cy3, Rox/Texas Red, Cy5; возможность количественной оценки патогенов, определения генной экспрессии, анализа однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), качественных исследований с применением внутреннего положительного контроля; система может быть доукомплектована для работы в режиме скоростного термоциклирования, до 7500 Fast.

Набор реагентов для экспресс-экстракции ДНК из образца при помощи специальных мембран (Q-Dip) и прямой ПЦР видоспецифичных участков с полиморфизмом длины гена цитохрома b митохондриальной ДНК 5 видов животных (козел – 159 п.н., курица – 228 п.н., корова – 273 п.н., овца – 334 п.н., свинья – 396 п.н.).

Детекция целевых ПЦР-продуктов проводится путем фрагментного анализа в неденатурирующих условиях с использованием интеркалирующего красителя на системах капиллярного электрофореза серии Qsep.

Анализ данных проводится при помощи стандартного ПО Q-Analyser.

• Анализ одно- и многокомпонентной продукции;
• анализ сырого мяса либо переработанной готовой продукции.

Товар временно недоступен. Аналоги по запросу ниже.

• Формат термоблока — 48-луночный;
• источник возбуждения — светодиоды;
• детектор флуоресценции – фотодиоды;
• количество каналов измерения флуоресценции — 3;
• длина волны возбуждения, нм — 475–495, 515–545, 530–560, 560–590, 615–645;
• длина волны флуоресценции, нм — 515–545, 565–585, 575–595, 610–640, 670–700;
• исполнительное устройство термоблока — элемент Пельтье;
• диапазон температур, °С — 4–100;
• гомогенность температур, °C — ± 0,5;
• точность поддержания температуры, °C — ±0,25;
• скорость нагрева/ охлаждения, °C/с — 4,6/4,6;
• реакционный объем, мкл — 10–40;
• продолжительность ПЦР, мин — 40;
• сенсорный дисплей;
• поставляется с ноутбуком;
• габариты, Ш х Г х В, мм — 246 х 427 х 512;
• масса, кг — 23,6.

Возможность работы с красителями: Fam/Sybr Green, Vic/Joe и Rox. Количественная оценка, определение генной экспрессии, анализ однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), качественных исследований с применением внутреннего положительного контроля; режим скоростной амплификации; дистанционное управление; e-mail — клиент; ПО QuickStart; система самодиагностики, может быть модернизирован до StepOne Plus.

Товар временно недоступен. Аналоги по запросу ниже.

Высокопроизводительная система капиллярного электрофореза.

• Количество капилляров в блоке — 48 или 96;
• улучшенный лазер с охлаждением;
• блок детекции — утонченная с обратной стороны ССD-камера, обеспечивает низкий шум и полный сбор данных от всех капилляров одновременно;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• формат планшет — 96 или 384 лунки;
• производительность за запуск, п.н. — 38,4 - 96,0 × 10³;
• система контроля и оптимизации расхода полимера;
• совместимые типы полимера — POP-7, POP CAP;
• автоматическая замена геля;
• автоматическая работа 48 часов без оператора;
• автозагрузчик планшет;
• встроенный считыватель штрих-кодов;
• обязательное подключение к ПК;
• индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
• габариты, Ш × Г × В, мм — 1000 × 650 × 930;
• вес, кг — 130.

Комплект поставки: генетический анализатор 3730xl (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), капиллярный блок на 96 капилляров, кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.

Программное обеспечение:

• Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
• SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
• Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
• GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
• Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
• MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).

Товар временно недоступен. Аналоги по запросу ниже.

• Количество капилляров в блоке — 4;
• длина капилляров, см — 28;
• формат — 96-луночные планшеты или 8-луночные стрипы;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• два типа картриджей: 125 инъекций (500 образцов) и 250 инъекций (1000 образцов);
• универсальный полимер (POP-1) для секвенирования и фрагментного анализа;
• не требует спектральной калибровки при использовании наборов Applied Biosystems;
• встроенное ПО для управления SeqStudio Data Collection;
• подключение к ПК – не обязательно;
• мощность (без компьютера), Вт — 271;
• габариты, Ш × Г ×В, мм — 495 × 648 × 442;
• вес, кг — 45,4.

• Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
• SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
• Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
• GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
• Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
• MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).

Комплект поставки: генетический анализатор SeqStudio (с основным ПО), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, ноутбук с установленной программой управления и сбора данных и анализа, стартовый набор для запуска прибора (4-х капиллярный картридж, протектор, катодный буфер, необходимые расходные материалы).

Дополнительно: однодневное обучение генетическому анализу.