DAPI (4′,6-диамидино-2-фенилиндол) — это синий флуоресцентный краситель ДНК, который усиливает флуоресценцию примерно в 20 раз при реагировании с AT-областями dsDNA. Он возбуждается фиолетовой (405 нм) лазерной линией и обычно используется в качестве ядерного контрокрасителя в окрашвании хромосом, флуоресцентной микроскопии, проточной цитометрии.
Спектральные свойства DAPI превращают его в идеальный при использовании с зелеными (Invitrogen Alexa Fluor 488, FITC, GFP) и красными (Invitrogen Alexa Fluor 594, родамин, Invitrogen Texas Red, mCherry, mKate-2) флуорофорами в многоцветных экспериментах.